O Nubea tem cinco laboratórios de pesquisa que promovem atividades de ensino, pesquisa e extensão.
Bioclin – Bioética Clínica
Labep – Ética em Pesquisa
Laberte – Ética nas Relações de Trabalho e Ensino
Labepog – Ética e Poder Global
Judipp – Justiça, Direitos Básicos e Políticas Públicas